京东不能使用支付宝付款的原因有以下几点：

1.支付宝与京东的竞争关系：支付宝和京东作为两家电商巨头，竞争关系较为激烈。在这种情况下，京东不愿意为自己的竞争对手提供付款渠道，从而避免为支付宝的发展提供帮助。

2.支付宝与京东的合作关系：支付宝与京东并没有建立合作关系，因此京东没有开通支付宝付款的渠道。相反，京东与微信支付、银联等支付机构建立了合作关系，为消费者提供了多种付款方式。

3.支付宝与京东的支付体系不兼容：支付宝和京东的支付体系不兼容，这也是京东无法开通支付宝付款的原因之一。如果京东想要支持支付宝付款，需要进行技术上的改进和升级，这需要耗费大量的时间和精力。

4.支付宝付款可能存在风险：京东可能认为支付宝付款存在一定的风险，例如支付宝账户被盗用、支付宝平台出现故障等情况，这可能会影响到京东的交易安全和用户体验。因此，京东可能选择不开通支付宝付款渠道，以保障自身的利益和用户的安全。