承担着北京市传染性疾病、慢性非传染性疾病、学生常见病、病媒生物传播疾病等预防与控制;突发公共卫生事件应急处置和疫情报告和信息管理;食品卫生、环境卫生、放射卫生和职业卫生等健康危害因素的监测与干预;全市居民的健康教育与健康促进和科研教学等工作。还承担着首都重大政治、经济、社会活动的公共卫生保障、首都生物反恐怖袭击应急等任务。

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